Supercomputer erhält leistungsfähige supercomputer für biomedizinische und life-Science-Forschung von IBM

Rice University und IBM ( IBM) hat heute ein neues high-performance-computing – (HPC) initiative für biomedical und life-sciences-Forschung, die verfügt über eines der leistungsfähigsten Supercomputer in dem Texas Medical Center. Reis Wissenschaftler verwenden die supercomputer gemeinsam mit Forschern über das medical center zu studieren, Krebs, AIDS und andere komplexe Krankheiten.

Die POWER7-based supercomputer ist das Mittelstück einer $7,6 Millionen IBM Shared University Research (SUR) Preis zum Reis für fortgeschrittene biomedizinische Forschung. Die award — das größte für HPC-Infrastruktur in Reis ist Geschichte-gehört auch HPC-software, Dienstleistungen und life-sciences-know-how von IBM. Dubbed „BlueBioU,“ die HPC-Projekt bringt Forscher aus Reis, IBM und von zusammenarbeitenden Partnern innerhalb des Texas Medical Center.

Der supercomputer an der Rice ist das erste system, das bereitgestellt wird mit IBMs neue POWER7-Mikroprozessoren, die macht es besonders attraktiv für die Forscher vor mit sehr anspruchsvollen und rechenintensiven Probleme oft begegnet in der biomedizinischen und life-Science-Forschung. Zum Beispiel, das system wird besonders nützlich sein für die genomische Sequenzierung, protein-Faltung, Drogen-Modellierung und die Simulationen von molekular-level-Interaktionen in den Geweben. Neben der Echtzeit-Analyse der POWER7 hardware und software sind gut geeignet für den Bergbau umfangreiche Genom-und medizinischen Datenbanken nach hinweisen auf neue Behandlungsmöglichkeiten und Heilmittel für Krankheiten.

Fähig zu teraflops 18,8-oder 18.8 Billionen Gleitkomma-Berechnungen pro Sekunde-die BlueBioU-Plattform ist genauso leistungsfähig wie die Summe der Reis der vorhandenen Supercomputer.

„Unsere vision ist die Erleichterung der Zusammenarbeit unter den Forschern und zwischen den Institutionen durch die Bereitstellung einer Weltklasse-computing-Ressourcen ist gut geeignet für eine Vielzahl von biowissenschaftlichen Anwendungen“, sagt Kamran Khan, Reis vice provost for information technology und einer der Reis, co-Leiter des Projekts.

„Es ist spannend, haben die weltweit erste POWER7-Cluster hier bei Reis. Die Produktivität und die performance-Vorteile der POWER7-Plattform sind gut ausgerichtet mit Reis zukünftige Richtungen für Forschung computing, sowie unser oberstes Ziel in der Arbeit mit den medical center zur Verbesserung der Behandlungsmöglichkeiten und neue Therapien für Patienten“, sagte der co-leader Vivek Sarkar, Reis E. D. Metzger Professor für Computer Science und professor für elektrische und computer engineering.

Das Texas Medical Center ist eine der weltweit größten medizinischen Einrichtungen. Das medical center ist 46 Mitglieds-Einrichtungen führen mehr als $1 Milliarde Wert der Forschung und sehen, mehr als 5 Millionen Patienten pro Jahr.

Baylor-College von Medizin (BCM), ein Texas Medical Center partner, der zusammen mit Reis auf die BlueBioU-Projekt plant Sie erforschen das gesamte Spektrum der genomischen Veränderung in der Krebs durch die Anwendung der Genom-Analyse-Technologien, einschließlich large-scale Sequenzierung des Genoms.

„Wir sind entsperren die Geheimnisse der menschlichen Krebs durch die Analyse der Genome von 50 Patienten mit Eierstock-Krebs zu entdecken, die mutation Profil zugrunde liegenden Ihre Krankheit,“ sagte BCM Kim Worley, associate professor für molekular-und Humangenetik. „Wenn Sie erfolgreich sind, werden wir analysieren, 1.000 Patienten mit verschiedenen Krebsarten im Laufe des nächsten Jahres. Dieses Projekt wird einen großen Einfluss auf unser Verständnis der Biologie von Krebs und möglicherweise zu identifizieren, mögliche zukünftige Behandlung Alleen.“

Weitgehend entwickelt bei IBM in Austin, Texas research labs, die Linux-basierte BlueBioU-system ist speziell für die parallele Verarbeitung, oder laufen Tausende von Programmen zur gleichen Zeit. Es hat 608 POWER7-Prozessoren, die in der Lage sind, gleichzeitig ausgeführt 2,432 Aufgaben.

„IBM‘ s $7,6 Millionen Spende ist eine bedeutende Investition in life sciences research in Texas und zur Förderung von Houston als premier research collaboration center,“, sagte Tony Befi, vice president, POWER Systems und IBM senior Exekutive für Texas. „Der POWER7 ist ideal für die Art der Forschung durchgeführt in Reis und dem Texas Medical Center und helfen, machen es möglich, zu erkennen und zu analysieren, Muster, die möglicherweise eines Tages zu wichtigen medizinischen Durchbrüchen und smarter healthcare.“

„Wir sind stolz, mit Reis auf einem Forschungsprojekt, das nicht nur unterstützt IBM weltweit die Hochschule Initiativen, aber so wichtig ist die Förderung der medizinischen Wissenschaft“, sagte Bernie Meyerson, IBM Fellow und vice president für innovation und global university programs. „Es ist spannend, dass wir heute verfügbaren Technologie, die helfen kann, die biomedizinische Forschung gegen einige der am meisten anspruchsvollen und komplexen Krankheiten, die wir Gesicht.“

Die BlueBioU-supercomputer befindet sich an der Rice ‚ s $16 Millionen state-of-the-art-Rechenzentrum, das unterstützt die neue grün-fähigen Technologien zur Verfügung, die auf der POWER7-Plattform. Die Energie-effiziente Funktionen, die POWER7-based supercomputer umfassen die Fähigkeit zum erstellen von Richtlinien und Protokolle zu optimieren, dass die balance zwischen Verbrauch und Leistung.

Das Rechenzentrum angeschlossen ist, um den Reis campus und Texas Medical Center-Partnern über eine neue $22 Millionen Netzwerk mit einer multi-gigabit-backbone und mehr als ein terabit an Gesamtbandbreite. Darüber hinaus Reis hat einen neuen high-availability-storage-Infrastruktur mit mehreren Terabyte Daten-Speicherung im data center.

Reis ist BlueBioU-team umfasst Khan, Sarkar, John Mellor-Crummey, professor für computer science und electrical and computer engineering; Kim Andrews, manager von Wissenschafts-und Forschungs-computing; und Chandler Wilkerson, lead system architect.

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